吸糞車與吸污車的外形不同，吸糞車一般為橢圓形罐體，尾部留有泄糞口，利用罐體的壓力差排除糞液，安裝進口防溢流裝置，防止糞便，污水因吸滿倒灌至真空泵系統，罐體龜北式設計，永不變形，安裝真空吸糞泵，吸糞導物管可360度旋轉，而吸污車為圓形罐體，吸污罐可液壓舉升自卸，后蓋可液壓打開，真空度高，吸程遠，排泄速度更快，更干凈，更便于吸污車罐體的清理。

從功能上區分：吸糞車主要用于抽吸糞便，污水，污泥漿和混有較小懸浮雜物的液體，具有抽吸效率高，自吸，自排及直灌等特點，適宜于大，中，小城鎮環衛，市政，農業，化工，廠礦企業，物業小區使用;利用真空吸糞泵自吸自排，排放采用自排和壓力排放。真空吸污車主要用于下水道，雨水井，檢查井，化糞池及各種溝渠內的污泥，糞便或石油化工廠污水池淤積物的抽吸，裝運和排卸：安裝進口防溢流裝罷，防止糞便，污水因吸滿倒灌至真空泵系統，安裝真空吸污泵，吸污泵可自吸自排，排放采用自排和壓力排放，受到罐體結構和形狀的影響，吸糞車的真空度和吸力沒有吸污車的大，吸糞車采用真空泵的壓力差排污，受到排污口的位置限制，較大石塊不能排出，不能用于較大物塊的清淤工作，吸污車采用液壓頂開排污結構，排污效率和排污效果要好。

主要配件的區別，吸糞車和吸污車都是采用威龍、億豐吸污泵，但是同樣的車型泵的功率是不一樣的，吸污車的所有泵體結構不同，功率更大吸程可以達到50米范圍將磚渣吸起，吸糞車吸程一般只能達到20米，吸污車罐體所承受的壓力比吸糞車大，所以罐體所用的板材，管件等配件都比吸糞車的耐壓指數高